在高華大學變異的經歷總在重演，關于軍方通緝的亦圍繞在腦海，科學家Bruce Banner就在這樣的夢魘下在巴西一邊控制著體內的伽馬輻射帶來的異常，一邊努力和紐約的藍先生尋求解決辦法在汽水生產廠房的他一日不小心割傷手指，讓血滴入了汽水瓶，遠銷到美國的這瓶汽水暴露了他的行蹤。美國軍方窮盡能力追捕他，還找來求勝心切的英國霹靂將軍Emil Blonsky。被逼到絕路的Bruce變身為綠巨人，Emil和其他軍人都大吃一驚。為了親手擒住Bruce，Emil建議給自己注入可使基因變異的樣本。Bruce在美國隱匿時遇到舊女友Betty Ross，Betty義無反顧地站在他一邊，同時發現，她擁有令他體內綠巨人安穩的力量。那邊Emil已經被求勝蒙蔽了眼睛，他的尋釁加上美國軍方極度想利用Bruce體內異能作為殘暴行徑的決心，一場大戰已經避無可避。